RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388948.7

LRRK1-201, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LRRK1, Length 7,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-201ENST00000388948 SNX33Q8WV41 574 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 MFSD3Q96ES6 412 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 NUMA1Q14980 2115 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 MTX2O75431 263 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 PPP2R2BQ00005 443 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 MON1BQ7L1V2 547 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ATRNO75882 1429 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 UBE2QL1A1L167 161 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 FAM25EA8MYX2 175 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM192Q8IY95 271 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 RNF39Q9H2S5 420 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 IL23AQ9NPF7 189 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ALPIP09923 528 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 CREB5Q02930 508 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 RIN1Q13671 783 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 FATE1Q969F0 183 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRK1-201ENST00000388948 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 WASH3PC4AMC7 463 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 IL33O95760 270 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 IFNA6P05013 189 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 VEGFBP49765 207 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 SNTA1Q13424 505 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 DHRS12A0PJE2 317 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 TRIM38O00635 465 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 COL6A1P12109 1028 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 NMBRP28336 390 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 CTSKP43235 329 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 GJD3Q8N144 294 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PMM1Q92871 262 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 ART4Q93070 314 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 MAN2B1O00754 1011 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PDPK1O15530 556 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A9O60656 530 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A6P19224 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A1P22309 533 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A4P22310 534 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A3P35503 534 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 G3V2T6 193 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 TPST2O60704 377 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 CLCQ05315 142 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PJA1Q8NG27 643 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 MAPK15Q8TD08 544 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 TFAP2BQ92481 460 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 FSCN2O14926 492 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 RAB25P57735 213 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 MIPEPQ99797 713 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PIGUQ9H490 435 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 PNPOQ9NVS9 261 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 MRC1P22897 1456 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 CD48P09326 243 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 ACADLP28330 430 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 ANKRD7Q92527 254 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 SSR3Q9UNL2 185 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 A0A087WXM4 84 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 KCNQ1P51787 676 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRK1-201ENST00000388948 TSC22D1Q15714 1073 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms