RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 CLCQ05315 142 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ODF4Q2M2E3 257 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ARCQ7LC44 396 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GIPC3Q8TF64 312 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 BCAP31P51572 246 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GMFBP60983 142 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 COQ8BQ96D53 544 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.53□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PIP5K1BO14986 540 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF208O43345 1280 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CLEC3AO75596 197 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GALNT7Q86SF2 657 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PLD5Q8N7P1 536 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MCFD2Q8NI22 146 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 POF1BQ8WVV4 589 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ING4Q9UNL4 249 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX12O00623 359 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 NFATC1O95644 943 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CSKP41240 450 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KLF10Q13118 480 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PARP15Q460N3 678 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC38Q5VT99 294 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 LPGAT1Q92604 370 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CD247P20963 164 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KELP23276 732 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GNA12Q03113 381 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 POTEHQ6S545 545 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 COL20A1Q9P218 1284 aa14.52□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC35F4A4IF30 521 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 E7ENX8 843 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 INSIG1O15503 277 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 STK16O75716 305 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UROSP10746 265 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TCF4P15884 667 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 HSF2Q03933 536 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DCST1Q5T197 706 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PLLPQ9Y342 182 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CILPO75339 1184 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MMP14P50281 582 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LIPEQ05469 1076 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MBD2Q9UBB5 411 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT1A6P19224 532 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT1A1P22309 533 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT1A4P22310 534 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT1A3P35503 534 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NDUFA9Q16795 377 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MREGQ8N565 214 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GKN1Q9NS71 199 aa14.52□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TRABD2AQ86V40 505 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR151Q8TDV0 419 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CBLP22681 906 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATC1Q76KD6 591 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 AADATQ8N5Z0 425 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 AP3S1Q92572 193 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PHF12Q96QT6 1004 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TGFB1P01137 390 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C8AP07357 584 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DGKGP49619 791 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TLE2Q04725 743 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RTKNQ9BST9 563 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms