RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 BLVRAP53004 296 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 AP1S2P56377 157 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 RPS14P62263 151 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ARSIQ5FYB1 569 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 PDZK1Q5T2W1 519 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 VITQ6UXI7 678 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 Q6ZVU0 165 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.28■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 FPGTO14772 594 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 VIPP01282 170 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 MPP2Q14168 576 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 HERVK_113Q902F9 699 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 LRRC72A6NJI9 287 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.523e-8■□□□□ 8.1
GALNT2-201ENST00000366672 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ARMC3Q5W041 872 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 LIX1Q8N485 282 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.27■□□□□ 0.52
GALNT2-201ENST00000366672 A0A0D9SEW6 157 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 CLDN7O95471 211 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 NUDT14O95848 222 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 EDN1P05305 212 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ALOX12P18054 663 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 PSMA3P25788 255 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 RGS21Q2M5E4 152 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 THAP5Q7Z6K1 395 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 GATAD2AQ86YP4 633 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 TLR9Q9NR96 1032 aa18.27■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 AP3D1O14617 1153 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF30P17039 623 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 MTHFRP42898 656 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 CCR4P51679 360 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ITGADQ13349 1161 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 TMEM135Q86UB9 458 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 AMZ2Q86W34 360 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 C11orf65Q8NCR3 313 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 OR52B2Q96RD2 323 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 OR2AG1Q9H205 316 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 EBF2Q9HAK2 575 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 MOCS1Q9NZB8 636 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 SLC28A2O43868 658 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 GJB5O95377 273 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ADH5P11766 374 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 SPIBQ01892 262 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 TRIQKQ629K1 86 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 MIPEPQ99797 713 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 EXD2Q9NVH0 621 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 GALPQ9UBC7 116 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 TAF1P21675 1872 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1B0GW55 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM234BA2RU67 622 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 M0QZQ0 153 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L2P0CJ85 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L3P0CJ86 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L4P0CJ87 422 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L5P0CJ88 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L6P0CJ89 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4L7P0CJ90 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 HNMTP50135 292 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 KIAA1191Q96A73 305 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 DUX4Q9UBX2 424 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 OR10H1Q9Y4A9 318 aa18.26■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 AQP12BA6NM10 295 aa18.25■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM25AB3EWG3 89 aa18.25■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM25CB3EWG5 89 aa18.25■□□□□ 0.51
GALNT2-201ENST00000366672 FAM25GB3EWG6 89 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms