RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 GALNT3Q14435 633 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CCDC190Q86UF4 302 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 SLC51BQ86UW2 128 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 OR2T12Q8NG77 320 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 NTAN1Q96AB6 310 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 FAM167AQ96KS9 214 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 TSGA13Q96PP4 275 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 VPS35Q96QK1 796 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 FCRL5Q96RD9 977 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 GON7Q9BXV9 100 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 C12orf10Q9HB07 376 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 TMEM45AQ9NWC5 275 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 C14orf119Q9NWQ9 140 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.42■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 SCN1AP35498 2009 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 FAM20BO75063 409 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CTSKP43235 329 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ADIGQ0VDE8 80 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 PIK3R3Q92569 461 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CCDC32Q9BV29 185 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ARNTLO00327 626 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP33O14559 1287 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ANXA9O76027 345 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A1P02730 911 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 SERPINF2P08697 491 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ITGA2P17301 1181 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ERVK-8P63133 956 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 DNTTP04053 509 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CYP4B1P13584 511 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 AIF1P55008 147 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 OR4D1Q15615 310 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 RAB43Q86YS6 212 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 KRT20P35900 424 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 AMHR2Q16671 573 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 OR2T11Q8NH01 316 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 GIPC2Q8TF65 315 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 KIF12Q96FN5 646 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 ZNF599Q96NL3 588 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN3-201ENST00000366554 RFX2P48378 723 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LIMK1P53667 647 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SLAMF1Q13291 335 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SETD6Q8TBK2 473 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 MEIOCA2RUB1 952 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GSTA4O15217 222 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SHOXO15266 292 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GRK5P34947 590 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 PWP1Q13610 501 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GALNT7Q86SF2 657 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FCGR1BQ92637 280 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TMCO6Q96DC7 493 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.39■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 UGT2B17O75795 530 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 UGT2B15P54855 530 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 RANBP10Q6VN20 620 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 AHSA2Q719I0 299 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.38■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 DET1Q7L5Y6 550 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms