RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 C2P06681 752 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 SLC35G4P0C7Q5 338 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A3P40879 764 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 BNIP3Q12983 259 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 CSRP2Q16527 193 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 ACSBG2Q5FVE4 666 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 LVRNQ6Q4G3 990 aa27.2■■□□□ 1.95
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GIPC1-201ENST00000345425 IL21RQ9HBE5 538 aa27.2■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 WASH6PQ9NQA3 447 aa27.2■■□□□ 1.95
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GIPC1-201ENST00000345425 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D29Q9UFV1 150 aa27.2■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 UAP1L1Q3KQV9 507 aa27.19■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa27.19■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 VPS11Q9H270 941 aa27.19■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM8Q9NQV8 689 aa27.19■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 AGPSO00116 658 aa27.18■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 SLC2A4P14672 509 aa27.18■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 MYO1HQ8N1T3 1032 aa27.18■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 FAM46DQ8NEK8 389 aa27.18■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 SAP25Q8TEE9 199 aa27.18■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 WWP1Q9H0M0 922 aa27.18■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PSMD13Q9UNM6 376 aa27.18■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PPM1 405 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 YY2O15391 372 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF883P0CG24 379 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC166P0CW27 439 aa27.17■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 F3P13726 295 aa27.17■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 MAPK9P45984 424 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PPM1JQ5JR12 505 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A45Q8N413 288 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa27.17■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 TMBIM4Q9HC24 238 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PCMTD2Q9NV79 361 aa27.17■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 OR5K4A6NMS3 321 aa27.16■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 OPA1O60313 960 aa27.16■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA12O60330 932 aa27.16■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa27.15■■□□□ 1.94
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GIPC1-201ENST00000345425 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa27.15■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa27.15■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8RI6L899 631 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 BRAFP15056 766 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 KRT4P19013 534 aa27.14■■□□□ 1.94
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