RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PHEXP78562 749 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TFF2Q03403 129 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 DLG1Q12959 904 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ITGA9Q13797 1035 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 STARD3Q14849 445 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 NXPE1Q8N323 547 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 PGBD3Q8N328 593 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 GIMAP5Q96F15 307 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 FBRSQ9HAH7 460 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 GPAMQ9HCL2 828 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.97□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 BIRC5O15392 142 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ESR1P03372 595 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 HOXB2P14652 356 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TAC1P20366 129 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 COL9A1P20849 921 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 C5AR1P21730 350 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 IRX4P78413 519 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZVL8 140 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 RBFAQ8N0V3 343 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 SCAIQ8N9R8 606 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 NXNL1Q96CM4 212 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 HAUS8Q9BT25 410 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 MECRQ9BV79 373 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 BOCQ9BWV1 1114 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 CDH19Q9H159 772 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 ABCG8Q9H221 673 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.96□□□□□ -1.45
CCR6-201ENST00000341935 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQF6 199 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SH3D21A4FU49 640 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 NEMP1O14524 444 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 WNT9AO14904 365 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 AGBL4Q5VU57 503 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CACUL1Q86Y37 369 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SCAMP4Q969E2 229 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 GPR78Q96P69 363 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CLPBQ9H078 707 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SMOXQ9NWM0 555 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 GALPQ9UBC7 116 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 MED16Q9Y2X0 877 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.96□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 STK25O00506 426 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms