RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RGS20O76081 388 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 EOMESO95936 686 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CPN2P22792 545 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CBX5P45973 191 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 AHSA2Q719I0 299 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MEIOBQ8N635 442 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HMGB4Q8WW32 186 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NUS1Q96E22 293 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF570Q96NI8 536 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RGS10O43665 173 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PBX1P40424 430 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PUDPQ08623 228 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC1A2P43004 574 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PRR5P85299 388 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC51AQ86UW1 340 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ARL10Q8N8L6 244 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 IL36AQ9UHA7 158 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 COX18Q8N8Q8 333 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A4Q969I6 547 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C8GP07360 202 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNB2P17787 502 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PDHA2P29803 388 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GAL3ST1Q99999 423 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 B4DGG1 531 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 IRF9Q00978 393 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CBX3Q13185 183 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HTRA1Q92743 480 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NKD1Q969G9 470 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 MED31Q9Y3C7 131 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 NR4A1P22736 598 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf65Q8NCR3 313 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35G5Q96KT7 338 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CDK15Q96Q40 435 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR51F1A6NGY5 319 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 A8MUA0 341 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 ALOX5P09917 674 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 C1QTNF8P60827 252 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 IDH3AP50213 366 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MXD1Q05195 221 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CBFBQ13951 182 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 ALPPL2P10696 532 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 THRBP10828 461 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GJA1P17302 382 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ACADLP28330 430 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KA3P51812 740 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CARD16Q5EG05 197 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM192Q8IY95 271 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SCGNO76038 276 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 STATHP02808 62 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CCR3P51677 355 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.04■■□□□ 1.12
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