RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 TPMTP51580 245 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPN5P54829 565 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V0D1P61421 351 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 MYLK3Q32MK0 819 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 KBTBD6Q86V97 674 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 NPAS2Q99743 824 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 GALPQ9UBC7 116 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP6CO00743 305 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 OR1I1O60431 355 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PEX19P40855 299 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 STX5Q13190 355 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PIGGQ5H8A4 983 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 GK5Q6ZS86 529 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF112Q9ULX5 631 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0U1RQS6 177 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ENO4A6NNW6 628 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 H7C0S8 307 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 FZD6O60353 706 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS26AO75436 327 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 SUPT3HO75486 399 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPRE2Q15555 327 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 AGKQ53H12 422 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 AADATQ8N5Z0 425 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB119Q8N690 84 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC7O00311 574 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 AZIN1O14977 448 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF217O75362 1048 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PRNPP04156 253 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 UGT2B4P06133 528 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 CD9P21926 228 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 BCKDHBP21953 392 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 P2RY2P41231 377 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 THOP1P52888 689 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PKNOX1P55347 436 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 CEACAM7Q14002 265 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PTK2BQ14289 1009 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 LPAL2Q16609 132 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP68Q76N32 757 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf60Q96EN9 201 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf30Q96M34 536 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC30A3Q99726 388 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17CQ9P0M4 197 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 PKP3Q9Y446 797 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 DMDP11532 3685 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 SYCE1LA8MT33 242 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP3K13O43283 966 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 NIPSNAP2O75323 286 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6AP2O75787 350 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ADH1BP00325 375 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 C5AR1P21730 350 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 ME2P23368 584 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-201ENST00000307180 DPP6P42658 865 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms