RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ITGA8P53708 1063 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 BRD3Q15059 726 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 NEPROQ6NW34 567 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LRRC6Q86X45 466 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LPGAT1Q92604 370 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TCF12Q99081 682 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CARD6Q9BX69 1037 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 FAM187AA6NFU0 413 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 JMJD7P0C870 316 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ITGB6P18564 788 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PGAM1P18669 254 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ITIH1P19827 911 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 NDUFS1P28331 727 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CCR7P32248 378 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 GFERP55789 205 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PLCL1Q15111 1095 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 BBS9Q3SYG4 887 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SYTL3Q4VX76 610 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CENPUQ71F23 418 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 KRT222Q8N1A0 295 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PWWP2AQ96N64 755 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 BIRC8Q96P09 236 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 THSD1Q9NS62 852 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PISDQ9UG56 409 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CACNA1BQ00975 2339 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RAD51CO43502 376 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ETV5P41161 510 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CRYMQ14894 314 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 LONRF1Q17RB8 773 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CLEC14AQ86T13 490 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 PDIK1LQ8N165 341 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 FGF11Q92914 225 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 RAB33BQ9H082 229 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 KLHL3Q9UH77 587 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CDC23Q9UJX2 597 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CDYLQ9Y232 598 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 SNX24Q9Y343 169 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 LAMA5O15230 3695 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 PFDN6O15212 129 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 GPC4O75487 556 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ACADLP28330 430 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 KRT33BQ14525 404 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 HIF1AQ16665 826 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 C9orf72Q96LT7 481 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 PANX3Q96QZ0 392 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 ERP44Q9BS26 406 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 NAT9Q9BTE0 207 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.13■□□□□ 0.81
RNPS1-201ENST00000301730 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms