RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 C3orf80F5H4A9 247 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 KMOO15229 486 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ADCY6O43306 1168 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 GDF11O95390 407 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SLC10A3P09131 477 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ITGB8P26012 769 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SLC7A1P30825 629 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 GARSP41250 739 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PSMD8P48556 350 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ENTPD1P49961 510 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 JAK3P52333 1124 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 DYNLT1P63172 113 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CDKL1Q00532 357 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PCLAFQ15004 111 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TGFBIQ15582 683 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 C6orf52Q5T4I8 152 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CDCP2Q5VXM1 449 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SIGIRRQ6IA17 410 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 FAM111BQ6SJ93 734 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TMC5Q6UXY8 1006 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 GPR180Q86V85 440 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CARM1Q86X55 608 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 DDHD1Q8NEL9 900 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RDM1Q8NG50 284 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 DOK1Q99704 481 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 FAM213AQ9BRX8 229 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 EXO5Q9H790 373 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RNF11Q9Y3C5 154 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ARID2Q68CP9 1835 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TRPM7Q96QT4 1865 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 BLACEA4D250 179 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CCDC154A6NI56 674 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TMEM210A6NLX4 147 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SNTNA6NMZ2 147 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TMEM114B3SHH9 223 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 DCXO43602 365 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TADA2AO75478 443 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RHBDL1O75783 438 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ITGB5P18084 799 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TPSB2P20231 275 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 C5AR1P21730 350 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PSMB10P40306 273 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 NAA20P61599 178 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 FAM189BP81408 668 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CDC20Q12834 499 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TNFAIP1Q13829 316 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 TPSAB1Q15661 275 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SPATA46Q5T0L3 261 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SFRP5Q5T4F7 317 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 MROH9Q5TGP6 573 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 UNC5AQ6ZN44 842 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 GPR141Q7Z602 305 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 DSELQ8IZU8 1212 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 LILRA2Q8N149 483 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PLD5Q8N7P1 536 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RHBDF1Q96CC6 855 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 CDRT15Q96T59 188 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PKP2Q99959 881 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 BBS2Q9BXC9 721 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 LHX5Q9H2C1 402 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 NEK6Q9HC98 313 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 RAB6BQ9NRW1 208 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 OLAHQ9NV23 265 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 PNPOQ9NVS9 261 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 WBP1LQ9NX94 342 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 COPG2Q9UBF2 871 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 EMCNQ9ULC0 261 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 A0A0A6YYJ9 748 aa8.99□□□□□ -0.97
MMP3-201ENST00000299855 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms