RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 CES3Q6UWW8 571 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MOB2Q70IA6 237 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 IL32P24001 234 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GULP1Q9UBP9 304 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SH3BGRLO75368 114 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RARAP10276 462 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 M0QYT0 321 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNQ2O43526 872 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FRZBQ92765 325 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PIM2Q9P1W9 311 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CLN5O75503 358 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CCNG2Q16589 344 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TXNL1O43396 289 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RAD51DO75771 328 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 UBXN7O94888 489 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP3A5P20815 502 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDH1Q08174 1060 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF460Q14592 562 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ILDR2Q71H61 639 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR156Q8NFN8 814 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MTMR9Q96QG7 549 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SCGB2A1O75556 95 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 EVI2BP34910 448 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TLE1Q04724 770 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP4X1Q8N118 509 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 U3KQV3 271 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TFPIP10646 304 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PEX2P28328 305 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 XKR3Q5GH77 459 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PIGXQ8TBF5 258 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 C7orf34Q96L11 122 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 IL22Q9GZX6 179 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCG8Q9H221 673 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACOX3O15254 700 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDK3Q00526 305 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM83AQ86UY5 434 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TAAR8Q969N4 342 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CTSHP09668 335 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ASPNQ9BXN1 380 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FBP2O00757 339 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LRG1P02750 347 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NUMBP49757 651 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC26A5P58743 744 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NFIXQ14938 502 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 C16orf46Q6P387 395 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10A4Q9H209 315 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PIGRP01833 764 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACOX1Q15067 660 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TIGD6Q17RP2 521 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KCTD9Q7L273 389 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 STK17BO94768 372 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MC2RQ01718 297 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PARP6Q2NL67 630 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NOTUMQ6P988 496 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SSX9Q7RTT3 188 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SP8Q8IXZ3 490 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 STRA6Q9BX79 667 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KLQ9UEF7 1012 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CMAHPQ9Y471 501 aa11.03□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 H7C417 338 aa11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms