RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 NME5P56597 212 aa23.5■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa23.5■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 SUN2Q9UH99 717 aa23.5■■□□□ 1.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 H0Y858 1186 aa23.49■■□□□ 1.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 DIO3P55073 304 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 FNDC5Q8NAU1 212 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2T11Q8NH01 316 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 KXD1Q9BQD3 176 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 COL4A3Q01955 1670 aa23.46■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ANGPT2O15123 496 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 SGTAO43765 313 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 KAT7O95251 611 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHX1P07099 455 aa23.45■■□□□ 1.35
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