RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630868.1

CDRT1-208, CMT1A duplicated region transcript 1, human

BASIC

Gene CDRT1, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDRT1-208	ENST00000630868	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SGCD	Q92629	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CORO2A	Q92828	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MYH6	P13533	1939 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC25A17	O43808	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NPS	P0C0P6	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GHR	P10912	638 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ERCC2	P18074	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ACADL	P28330	430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CNR2	P34972	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TXK	P42681	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TUBB4B	P68371	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SCN1B	Q07699	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LPIN1	Q14693	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PGM5	Q15124	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PTPRR	Q15256	657 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DLG2	Q15700	870 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	HSPB2	Q16082	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DUSP6	Q16828	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CADM3	Q8N126	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	AK8	Q96MA6	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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