RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF583Q96ND8 569 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR2A14Q96R47 310 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 FCRL5Q96RD9 977 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM209Q96SK2 561 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 EHD3Q9NZN3 535 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RIPK3Q9Y572 518 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 A0A0X1KG70 313 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 C9JVG2 144 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 B4GALT5O43286 388 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 DFNA5O60443 496 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SEC22BO75396 215 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 RETP07949 1114 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 S100A5P33763 92 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIK3CBP42338 1070 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SUOXP51687 545 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 OSTNP61366 133 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 CSNK2BP67870 215 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAD51Q06609 339 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 IKZF1Q13422 519 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 FUT11Q495W5 492 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 XKRXQ6PP77 449 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 DET1Q7L5Y6 550 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACOT1Q86TX2 421 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 DEFB106AQ8N104 65 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PITX2Q99697 317 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 APOL4Q9BPW4 351 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 V9GYQ6 96 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PCM1Q15154 2024 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 CTDSP2O14595 271 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 AIREO43918 545 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SSX4O60224 188 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 HS6ST1O60243 411 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 IL7P13232 177 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 CYP2C18P33260 490 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 CTSKP43235 329 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAGEA2P43356 314 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 UFM1P61960 85 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ERVK-8P63133 956 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 IL5RAQ01344 420 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PWP1Q13610 501 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 EML3Q32P44 896 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 MLIPQ5VWP3 458 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM83AQ86UY5 434 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PAF1Q8N7H5 531 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 FRS2Q8WU20 508 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC7A6Q92536 515 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PTERQ96BW5 349 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC39A13Q96H72 371 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 NUAK2Q9H093 628 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACTR8Q9H981 624 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPP3Q9NY33 737 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 RNF6Q9Y252 685 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 NUP205Q92621 2012 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 A0A075B6Q4 140 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 A0A087WZ62 844 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBBXA8MT70 800 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-212ENST00000620722 M0R082 166 aa6.89□□□□□ -1.31
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