RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR2A25	A4D2G3	310 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM178B	H3BS89	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GH2	P01242	217 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT19	P08727	400 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SELL	P14151	372 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITGA2	P17301	1181 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	S1PR1	P21453	382 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NMBR	P28336	390 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCKAR	P32238	428 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLIN5	Q00G26	463 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT79	Q5XKE5	535 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NRROS	Q86YC3	692 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCML4	Q8N228	414 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC5A8	Q8N695	610 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR5R1	Q8NH85	324 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMO3	Q8TAP4	145 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIGT	Q969N2	578 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BICD1	Q96G01	975 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DACH2	Q96NX9	599 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CSTL1	Q9H114	145 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GAREM1	Q9H706	876 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCA3	Q99758	1704 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTNAP1	P78357	1384 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DENND3	A2RUS2	1198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLOD5	A6NK44	160 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494		A6NL46	340 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PROB1	E7EW31	1015 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494		J3QR06	171 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLK4	O00444	970 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF217	O75362	1048 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	AVIL	O75366	819 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PGM3	O95394	542 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BCL10	O95999	233 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	VPREB1	P12018	145 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDH1	P12830	882 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GJA1	P17302	382 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UGT1A1	P22309	533 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HRH2	P25021	359 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP8	P40818	1118 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MMP14	P50281	582 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PNLIPRP2	P54317	469 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIF5A	Q12840	1032 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBTB17	Q13105	803 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KEAP1	Q14145	624 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BECN1	Q14457	450 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCLAF	Q15004	111 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALS2CL	Q60I27	953 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SATL1	Q86VE3	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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