RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CDH19Q9H159 772 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 NOTCH2Q04721 2471 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 POM121BA6NF01 834 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CLGNO14967 610 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 TSHRP16473 764 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 AKT1P31749 480 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 FOXN2P32314 431 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CA5AP35218 305 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 NUDT1P36639 197 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 DPTQ07507 201 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 SEMA3AQ14563 771 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 INPP5AQ14642 412 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 STAT4Q14765 748 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 BRD3Q15059 726 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 NEPROQ6NW34 567 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 EMBQ6PCB8 327 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 SNX20Q7Z614 316 aa8.32□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 WDR26Q9H7D7 661 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 DMTF1Q9Y222 760 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 OR1A2Q9Y585 309 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 A6NNZ2 444 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 C10orf142B7Z368 130 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 H7C0S8 307 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 RIPK2O43353 540 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 MTX2O75431 263 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 SPAG6O75602 509 aa8.31□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 ASMTLO95671 621 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PYGLP06737 847 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 THBS1P07996 1170 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 GP1BBP13224 206 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PSMA3P25788 255 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 STX2P32856 288 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC1A2P43004 574 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CTSKP43235 329 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 THOP1P52888 689 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 UCNP55089 124 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 MPP1Q00013 466 aa8.31□□□□□ -1.08
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NEDD4L-218ENST00000587547 MGAT5Q09328 741 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 CTBP1Q13363 440 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 DBN1Q16643 649 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 GPR33Q49SQ1 333 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 BROXQ5VW32 411 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-218ENST00000587547 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.31□□□□□ -1.08
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