RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568232.1

CLK3-222, Transcript of CDC like kinase 3, human

Gene CLK3, Length 958 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK3-222	ENST00000568232	CD1E	P15812	388 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	MIP	P30301	263 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SOX5	P35711	763 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	FOLR3	P41439	243 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PREP	P48147	710 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CDH6	P55285	790 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TLE4	Q04727	773 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232		Q0VFX4	171 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	GALNT3	Q14435	633 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SLC9A5	Q14940	896 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	QPCT	Q16769	361 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	EPHB6	O15197	1021 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SLC4A1	P02730	911 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	UMOD	P07911	640 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PIRT	P0C851	137 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CDH3	P22223	829 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PBX1	P40424	430 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	LMAN1	P49257	510 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ART1	P52961	327 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PRSS12	P56730	875 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	JAM2	P57087	298 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TLR1	Q15399	786 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ASIC2	Q16515	512 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CEP97	Q8IW35	865 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TAAR6	Q96RI8	345 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232		E7EQ34	232 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232		H3BRJ5	948 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	AGPS	O00116	658 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	VEGFD	O43915	354 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	UNC5C	O95185	931 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	ST6GAL1	P15907	406 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	DES	P17661	470 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	VCL	P18206	1134 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLK3-222	ENST00000568232	PTER	Q96BW5	349 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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