RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUV39H1O43463 412 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCA5LO95447 670 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 FTCDO95954 541 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 NTRK1P04629 796 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DNASE1L3Q13609 305 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DESI2Q9BSY9 194 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPN3Q9H201 632 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0U1RQJ8 604 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSAPA4D1B5 854 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 OR5K3A6NET4 321 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 MGAT4DA6NG13 374 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLCD2A6NGC4 264 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7EM74 188 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 RWDD2BP57060 319 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBX1P83916 185 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 XIAPP98170 497 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 MC1RQ01726 317 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT33BQ14525 404 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 XKR5Q6UX68 686 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OOSP2Q86WS3 158 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATA13Q96N96 652 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PANX2Q96RD6 677 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 HGH1Q9BTY7 390 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE7BQ9NP56 450 aa7□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHA6Q9UF33 1036 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC24A2Q9UI40 661 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 RARRES3Q9UL19 164 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7□□□□□ -1.29
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