RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567234.1

LINC00543-201, long intergenic non-protein coding RNA 543, humanhuman

BASIC

Gene LINC00543, Length 1,845 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00543-201ENST00000567234 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 H0YJX3 145 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PPP6CO00743 305 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ESRRBO95718 433 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 C1SP09871 688 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DGKGP49619 791 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SPIDRQ14159 915 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PTK2BQ14289 1009 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SBSNQ6UWP8 590 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ZBTB2Q8N680 514 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 MARK4Q96L34 752 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 COPS8Q99627 209 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 AIM2O14862 343 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 RAD51BO15315 384 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CAPNS1P04632 268 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CBSLP0DN79 551 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ETS2P15036 469 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CBSP35520 551 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NRIP1P48552 1158 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NUDT2P50583 147 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 APOFQ13790 326 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ARHGEF7Q14155 803 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 EML3Q32P44 896 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DSELQ8IZU8 1212 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 HGH1Q9BTY7 390 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PRO3102Q9H379 93 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DKK3Q9UBP4 350 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 H3BNX3 289 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 E2F3O00716 465 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 TRIM16O95361 564 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 VIPR1P32241 457 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 MTTPP55157 894 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PKNOX1P55347 436 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 STX5Q13190 355 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 TRIP10Q15642 601 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PDPRQ8NCN5 879 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF382Q96SR6 550 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 SERPINI1Q99574 410 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 CCT7Q99832 543 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 RAD18Q9NS91 495 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 SMOXQ9NWM0 555 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 OARD1Q9Y530 152 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 TTC34A8MYJ7 566 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 TRIM24O15164 1050 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 UROSP10746 265 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PEX2P28328 305 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 AGTR2P50052 363 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 DCDC1P59894 354 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 DUSP6Q16828 381 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 GAB3Q8WWW8 586 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 RCN3Q96D15 328 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 C3orf30Q96M34 536 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 HAUS8Q9BT25 410 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 GIPC1O14908 333 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 PIP5K1BO14986 540 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 LEFTY1O75610 366 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 CDK4P11802 303 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 CD1EP15812 388 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00543-201ENST00000567234 FOXA1P55317 472 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms