RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	APRT	P07741	180 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ADRA1D	P25100	572 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FOXN2	P32314	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GRIA1	P42261	906 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	NSG1	P42857	185 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ACVR1	Q04771	509 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ITIH4	Q14624	930 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DBN1	Q16643	649 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	WBP1	Q96G27	269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	KALRN	O60229	2985 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	NDUFS1	P28331	727 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	RPA4	Q13156	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TTC9	Q92623	222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	NKD1	Q969G9	470 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	AP3B1	O00203	1094 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	RASSF9	O75901	435 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	POLB	P06746	335 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CXCR5	P32302	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CD151	P48509	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SEPHS1	P49903	392 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	GSE1	Q14687	1217 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	VASH2	Q86V25	355 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	UBXN4	Q92575	508 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	PBK	Q96KB5	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CD180	Q99467	661 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TTC1	Q99614	292 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CTRC	Q99895	268 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	RAD1	O60671	282 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	FTH1	P02794	183 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	KCNJ1	P48048	391 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	CDK16	Q00536	496 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-231	ENST00000566784	FOXM1	Q08050	763 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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