RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560462.1

HERC1-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 2

Gene HERC1, Length 647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-208	ENST00000560462	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	FAM222B	Q8WU58	562 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PERP	Q96FX8	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SERPINB11	Q96P15	392 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KCND1	Q9NSA2	647 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	CES2	O00748	559 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	UBXN7	O94888	489 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KLHL18	O94889	574 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	EML2	O95834	649 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	RPS6KB1	P23443	525 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PEX19	P40855	299 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ASPA	P45381	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	CTSC	P53634	463 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TUBB4B	P68371	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PMP22	Q01453	160 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	OCRL	Q01968	901 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	INCA1	Q0VD86	236 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TUBB2A	Q13885	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	C3orf56	Q8N813	242 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	OR8K5	Q8NH50	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PIGT	Q969N2	578 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	STRA6	Q9BX79	667 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	RNF112	Q9ULX5	631 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	IKBKB	O14920	756 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ZNHIT1	O43257	154 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	OIP5	O43482	229 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DTNB	O60941	627 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ULK1	O75385	1050 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	CLDN11	O75508	207 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	JCHAIN	P01591	159 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	RHOC	P08134	193 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	IRAK1	P51617	712 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SUOX	P51687	545 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DAOA	P59103	153 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	DLG4	P78352	724 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	KRT85	P78386	507 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	GUCY1A3	Q02108	690 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PSMD6	Q15008	389 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	BRD3	Q15059	726 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	IRGC	Q6NXR0	463 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	FBXL22	Q6P050	247 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PNCK	Q6P2M8	343 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	IYD	Q6PHW0	289 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	AVL9	Q8NBF6	648 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	HMCES	Q96FZ2	354 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	OR2M4	Q96R27	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HERC1-208	ENST00000560462	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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