RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 ITKQ08881 620 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 GALNT3Q14435 633 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 IHHQ14623 411 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC9A5Q14940 896 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CEBPEQ15744 281 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 RPE65Q16518 533 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 C3AR1Q16581 482 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CA9Q16790 459 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 AGAP9Q5VTM2 703 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ALS2CLQ60I27 953 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM198Q66K66 360 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 WDR59Q6PJI9 974 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFX8Q6ZV50 586 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRTM4Q86VH4 590 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 NLRP8Q86W28 1048 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRN4CLQ8ND94 238 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR2Y1Q8NGV0 311 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPS8L1Q8TE68 723 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 COG1Q8WTW3 980 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CPLX3Q8WVH0 158 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SMARCE1Q969G3 411 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTERQ96BW5 349 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF653Q96CK0 615 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 AGAP3Q96P47 875 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CD180Q99467 661 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 FOXC2Q99958 501 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 MGME1Q9BQP7 344 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDC1Q9BTX1 674 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 DHRS4Q9BTZ2 278 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SPATA16Q9BXB7 569 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 KLHL25Q9H0H3 589 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ENKD1Q9H0I2 346 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CARD9Q9H257 536 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM39Q9HCM9 518 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC6A20Q9NP91 592 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 NT5MQ9NPB1 228 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 DLL4Q9NR61 685 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDOR1Q9UHB4 597 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 TINAGQ9UJW2 476 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SERTAD3Q9UJW9 196 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDC23Q9UJX2 597 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 PSMD13Q9UNM6 376 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 AP4E1Q9UPM8 1137 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDYLQ9Y232 598 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHKBQ9Y259 395 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 FHOD1Q9Y613 1164 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 MPDZO75970 2070 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARID1AO14497 2285 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 BICDL2A1A5D9 508 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 GSAPA4D1B5 854 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SIGLEC16A6NMB1 481 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPR89AB7ZAQ6 455 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 E7EQ34 232 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SOCS6O14544 535 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNHIT1O43257 154 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 HCRTR1O43613 425 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 VEGFDO43915 354 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAFKO60675 156 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR2B3O76000 313 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDK14O94921 469 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLCO2B1O94956 709 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC4A1P02730 911 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 CTSBP07858 339 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 HBQ1P09105 142 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPR89BP0CG08 455 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms