RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP15	P51511	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PMP22	Q01453	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAF13	Q15543	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP27	Q9H306	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRLR	P16471	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CBL	P22681	906 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHRNB4	P30926	498 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR1D2	Q14995	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	WBP2	Q969T9	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSPG5	O95196	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPO	P07202	933 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SELL	P14151	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCT	P40126	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NRIP1	P48552	1158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	STAT2	P52630	851 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKG2	Q13237	762 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	IRF3	Q14653	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MELK	Q14680	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLG2	Q15700	870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSMD14	O00487	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	EDIL3	O43854	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLIPR1	P48060	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RALBP1	Q15311	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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