RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	UBXN4	Q92575	508 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CASS4	Q9NQ75	786 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	PAK5	Q9P286	719 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	QSOX1	O00391	747 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CCL22	O00626	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	RAD1	O60671	282 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	DLGAP3	O95886	979 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	GAS8	O95995	478 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	IFNB1	P01574	187 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	FGF5	P12034	268 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	ADRA1D	P25100	572 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	NSG1	P42857	185 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	VASH2	Q86V25	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CS-223	ENST00000551137	SEC16A	O15027	2179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	AP3B1	O00203	1094 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	NRDC	O43847	1150 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	STK17B	O94768	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FOXN2	P32314	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GRIA1	P42261	906 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SEPT6	Q14141	434 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	DBN1	Q16643	649 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ESX1	Q8N693	406 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MED8	Q96G25	268 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CTRC	Q99895	268 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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