RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
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PTPRB-209ENST00000550857 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-209ENST00000550857 LIASO43766 372 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 CD46P15529 392 aa7.93□□□□□ -1.14
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