RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 SGO1Q5FBB7 561 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
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PRDM4-205ENST00000550376 DEC1Q9P2X7 70 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 STOML1Q9UBI4 398 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 DPP7Q9UHL4 492 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 OARD1Q9Y530 152 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.58■□□□□ 0.89
PRDM4-205ENST00000550376 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.58■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 STX1BP61266 288 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 RPS6KA2Q15349 733 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PIGGQ5H8A4 983 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM74Q86UV6 250 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PYCR2Q96C36 320 aa20.58■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.58■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 VCLP18206 1134 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PSME3P61289 254 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 LRP8Q14114 963 aa20.57■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.57■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.57■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 OR56A5P0C7T3 313 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TAF11Q15544 211 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 Q6ZSR9 355 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 VPS33AQ96AX1 596 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.57■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.57■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 MRASO14807 208 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 NRP2O60462 931 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ELFN1P0C7U0 828 aa20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PDPRQ8NCN5 879 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF382Q96SR6 550 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ARL15Q9NXU5 204 aa20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 CTSCP53634 463 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN5P54829 565 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 UFM1P61960 85 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 AP2B1P63010 937 aa20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.56■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 CCNG1P51959 295 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 MIER2Q8N344 545 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SFRP1Q8N474 314 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ELMO1Q92556 727 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 CD244Q9BZW8 370 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TRAF3Q13114 568 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 KCNC3Q14003 757 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF234Q14588 700 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 MUM1Q2TAK8 710 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ARRDC3Q96B67 414 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD11Q96NU1 681 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 MAP10Q9P2G4 905 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 OPTCQ9UBM4 332 aa20.55■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SPINT1O43278 529 aa20.54■□□□□ 0.88
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