RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MGAT4DA6NG13 374 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SEMA7AO75326 666 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CDH3P22223 829 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 NR2C2P49116 596 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PRKAA1Q13131 559 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TFDP2Q14188 446 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 KRT33BQ14525 404 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PTPRCAPQ14761 206 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LLGL1Q15334 1064 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLC1A5Q15758 541 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 KAZNQ674X7 775 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LCN10Q6JVE6 187 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF398Q8TD17 642 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CPT1BQ92523 772 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PPM1MQ96MI6 270 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 FCRL5Q96RD9 977 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TLR10Q9BXR5 811 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MFRPQ9BY79 579 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 FANCEQ9HB96 536 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LUZP4Q9P127 313 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MAP10Q9P2G4 905 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MED13Q9UHV7 2174 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SYCE3A1L190 88 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 A6NL46 340 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MEN1O00255 615 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF185O15231 689 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CST8O60676 142 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 DPM1O60762 260 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TMEM63AO94886 807 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 POLBP06746 335 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 HLA-DPA1P20036 260 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 DSELQ8IZU8 1212 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CARFQ8N187 725 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 OR2L2Q8NH16 312 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 NAT14Q8WUY8 206 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LRFN5Q96NI6 719 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TCFL5Q9UL49 500 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 LCA5LO95447 670 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PRAMEF1O95521 474 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLC1A1P43005 524 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 MPP3Q13368 585 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF567Q8N184 647 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 P3H4Q92791 437 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 NLNQ9BYT8 704 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 ASB8Q9H765 288 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CASS4Q9NQ75 786 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SMOXQ9NWM0 555 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 BTRCQ9Y297 605 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 A1L4Q6 167 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 KLHL33A6NCF5 533 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 SPOPO43791 374 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 CEACAM4O75871 244 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-214ENST00000548849 NDUFS1P28331 727 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms