RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 PTGER2P43116 358 aa3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 RAB13P51153 203 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CLCN4P51793 760 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 POU5F1BQ06416 359 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 PPP2R2BQ00005 443 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.918e-8■■■■□ 26.5
JMJD1C-210ENST00000542921 FGL2Q14314 439 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HERC3Q15034 1050 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MYLK3Q32MK0 819 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CES5AQ6NT32 575 aa3.12□□□□□ -1.91
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