RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528098.5

SLC43A3-209, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 1,260 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-209ENST00000528098 DDA1Q9BW61 102 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ABCG8Q9H221 673 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ARL5AQ9Y689 179 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PFDN6O15212 129 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 INPP4BO15327 924 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FAM87AP0C7U9 286 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PSMA3P25788 255 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ACVR1Q04771 509 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 LINC00303Q3SY05 128 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TMEM135Q86UB9 458 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CCDC25Q86WR0 208 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PALM2Q8IXS6 379 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 EXD3Q8N9H8 876 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 AVL9Q8NBF6 648 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PATE1Q8WXA2 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SCAMP4Q969E2 229 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 NFU1Q9UMS0 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 AURKAO14965 403 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PPM1DO15297 605 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FUCA1P04066 466 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 THRAP10827 490 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ITGALP20701 1170 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PHBP35232 272 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ELK3P41970 407 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FASLGP48023 281 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CSRP3P50461 194 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 HHEXQ03014 270 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SQSTM1Q13501 440 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TRADDQ15628 312 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TBR1Q16650 682 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 GPR33Q49SQ1 333 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 PYCR3Q53H96 274 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 BORAQ6PGQ7 559 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CALML6Q8TD86 181 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ULK4Q96C45 1275 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SGSM3Q96HU1 749 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 RMI1Q9H9A7 625 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TREX1Q9NSU2 369 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 STARD5Q9NSY2 213 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 VPS18Q9P253 973 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 EFCAB7A8K855 629 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 B4E171 279 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ERLIN1O75477 346 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 BPIP17213 487 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 MPSTP25325 297 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 TSPAN7P41732 249 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 MAGEA4P43358 317 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CRADDP78560 199 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 LONRF1Q17RB8 773 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 EMBQ6PCB8 327 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC43A3-209ENST00000528098 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms