RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KDM1BQ8NB78 822 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MCUQ8NE86 351 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 B8ZZF3 427 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 INPP4BO15327 924 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D4O60343 1298 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CHRM3P20309 590 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 GPR158Q5T848 1215 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NETO2Q8NC67 525 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CDKL2Q92772 493 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PEX13Q92968 403 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CD207Q9UJ71 328 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GABARAPO95166 117 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 USP17L7P0C7H9 530 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 WEE1P30291 646 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAA1Q13131 559 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SDE2Q6IQ49 451 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 LACC1Q8IV20 430 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 METTL4Q8N3J2 472 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 OMA1Q96E52 524 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 BCO2Q9BYV7 579 aa9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 CENPXA8MT69 81 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 KRT6BP04259 564 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IFI30P13284 250 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.812e-9■■■□□ 15.8
TRPS1-211ENST00000520276 PDGFRAP16234 1089 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PCMT1P22061 227 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IL4RP24394 825 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TAF10Q12962 218 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 BNIP2Q12982 314 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DGCR6Q14129 220 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 STEAP4Q687X5 459 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IFNEQ86WN2 208 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ING5Q8WYH8 240 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RTP4Q96DX8 246 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 TASP1Q9H6P5 420 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 MAFFQ9ULX9 164 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-211ENST00000520276 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HTR3AP46098 478 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LIPMQ5VYY2 423 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC14AQ86T13 490 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GPR65Q8IYL9 337 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TRPV3Q8NET8 790 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 OR10T2Q8NGX3 314 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC120Q96HB5 630 aa9.96□□□□□ -0.82
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