RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.09■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP99D6REC4 459 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 SUN1O94901 812 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 LIFP15018 202 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CXCR5P32302 372 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CACNG1Q06432 222 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLCL1Q15111 1095 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEACAM20Q6UY09 585 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRSS42Q7Z5A4 293 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 IL22RA1Q8N6P7 574 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 HM13Q8TCT9 377 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF778Q96MU6 729 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 NRTNQ99748 197 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 EPHA6Q9UF33 1036 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRSS21Q9Y6M0 314 aa24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 FGGP02679 453 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF28P17035 718 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 FOXN2P32314 431 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 LMAN1P49257 510 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP1A2P50993 1020 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDH17Q12864 832 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEMA5AQ13591 1074 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCNG2Q16589 344 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAB33BQ9H082 229 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 COG4Q9H9E3 785 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC24A2Q9UI40 661 aa24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 E7EVH7 732 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 STK17BO94768 372 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDHA2P29803 388 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNJ1P48048 391 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 LINC00303Q3SY05 128 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CERS6Q6ZMG9 384 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 UNC5BQ8IZJ1 945 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF843Q8N446 348 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC89Q8N998 374 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 HEXDCQ8WVB3 486 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 KLHL6Q8WZ60 621 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZDHHC12Q96GR4 267 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR6C1Q96RD1 312 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K3Q99759 626 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CASS4Q9NQ75 786 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 BAHCC1Q9P281 2608 aa24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 KLHL33A6NCF5 533 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 APRTP07741 180 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PREPP48147 710 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 GSE1Q14687 1217 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNAB1Q14722 419 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 EXTL1Q92935 676 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 HDAC10Q969S8 669 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 WBP1Q96G27 269 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPM1MQ96MI6 270 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PAK5Q9P286 719 aa24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR6C74A6NCV1 312 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR5K3A6NET4 321 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP104O60308 925 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 DLGAP3O95886 979 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 EXD3Q8N9H8 876 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHC3Q8NDX5 983 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM58Q8NG06 486 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZPBPQ9BS86 351 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 HEATR9A2RTY3 570 aa24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 GOT2P00505 430 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 FOLR1P15328 257 aa24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 NAPRTQ6XQN6 538 aa24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 RANBP9Q96S59 729 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms