RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ACTL9Q8TC94 416 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ACTL8Q9H568 366 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TLK1Q9UKI8 766 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OR6C74A6NCV1 312 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 C5orf60A6NFR6 353 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SGTAO43765 313 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RFPL1O75677 317 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PSMB4P28070 264 aa16.5■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 PMS2P54278 862 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 XIAPP98170 497 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 GSE1Q14687 1217 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SPA17Q15506 151 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 GPR19Q15760 415 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 BCL7AQ4VC05 210 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PPM1MQ96MI6 270 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.5■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 DNAJB5O75953 348 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CTNNA2P26232 953 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 COPS2P61201 443 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS15P98073 1019 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TUBB2AQ13885 445 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PRPSAP1Q14558 356 aa16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.49■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 TRIM5Q9C035 493 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 KCND1Q9NSA2 647 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PLAAQ9Y263 795 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.49■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 AGAP14A8MT82 685 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 KCNN4O15554 427 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SCRG1O75711 98 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CRTAMO95727 393 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RBP3P10745 1247 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RALBP11234 206 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PDE1BQ01064 536 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SEMA5AQ13591 1074 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 KRT33BQ14525 404 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MR1Q95460 341 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ULK4Q96C45 1275 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.48■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RCCD1A6NED2 376 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CCL22O00626 93 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PJA2O43164 708 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PDGFAP04085 211 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PYGMP11217 842 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 NDUFS1P28331 727 aa16.47■□□□□ 0.23
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