RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TPSB2P20231 275 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 NMBRP28336 390 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 GPS1Q13098 491 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TPSAB1Q15661 275 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PACS1Q6VY07 963 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPRTQ6XQN6 538 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP206Q8IYR0 622 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 AGBL5Q8NDL9 886 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52A5Q9H2C5 316 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PRORYQ9H606 182 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TREX1Q9NSU2 369 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSL6Q9UKU0 697 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF2O75151 1096 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 AVILO75366 819 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 AMD1P17707 334 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PDHA2P29803 388 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CXADRP78310 365 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCL1Q15111 1095 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKS6Q68DC2 871 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CES3Q6UWW8 571 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM92BQ6ZTR7 304 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MPP5Q8N3R9 675 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CTRCQ99895 268 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB41L1Q9H4G0 881 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 APMAPQ9HDC9 416 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR70Q9NW82 654 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ARNTP27540 789 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ITIH4Q14624 930 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IRGCQ6NXR0 463 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 VASH2Q86V25 355 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4L1Q8NH43 312 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CPT1BQ92523 772 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD3Q96ES6 412 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf72Q96LT7 481 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD34CP0C6C1 535 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 LIPCP11150 499 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB6P18564 788 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NSG1P42857 185 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA6P43360 314 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPHS1P49903 392 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BP2P78314 561 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEP78395 509 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 BRD3Q15059 726 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PCID2Q5JVF3 399 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf22Q6V702 233 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXDC1Q8IUK5 500 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 AP2A2O94973 939 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS3P57727 454 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS42Q7Z5A4 293 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.24■□□□□ 0.515e-14■■■□□ 16
SH3BP2-218ENST00000511185 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1MQ96MI6 270 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TAAR9Q96RI9 348 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 HGH1Q9BTY7 390 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 DPH1Q9BZG8 443 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IL22Q9GZX6 179 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 FER1L5A0AVI2 2057 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1GO43497 2377 aa18.23■□□□□ 0.51
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