RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 KYQ8NBH2 561 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 GALPQ9UBC7 116 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 PSMD13Q9UNM6 376 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SIGLEC6O43699 453 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 APOA4P06727 396 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 F3P13726 295 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 CDKN2DP55273 166 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 PIM3Q86V86 326 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 GIMAP7Q8NHV1 300 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 PATE1Q8WXA2 126 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 TMEM159Q96B96 161 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 ELMO2Q96JJ3 720 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 PAFAH2Q99487 392 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 ACSL5Q9ULC5 683 aa29.02■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SPEGQ15772 3267 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SH3BP5O60239 455 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 VPS26AO75436 327 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC35G4P0C7Q5 338 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 CLCN7P51798 805 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 LIMK2P53671 638 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 HSPA14Q0VDF9 509 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 GRTP1Q5TC63 336 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 HECTD2Q5U5R9 776 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM45BPQ6NSW5 357 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 NAGSQ8N159 534 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 ARL10Q8N8L6 244 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 ACVR1CQ8NER5 493 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM45AQ8TCE6 357 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 GPR21Q99679 349 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 WDR37Q9Y2I8 494 aa29.01■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC5A10A0PJK1 596 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 KPNA5O15131 536 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 BRAFP15056 766 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 PDHA2P29803 388 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 RPA4Q13156 261 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 AGAP9Q5VTM2 703 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC35F3Q8IY50 421 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB2Q8N680 514 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 RHBDD1Q8TEB9 315 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ASZ1Q8WWH4 475 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC44A1Q8WWI5 657 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 CAMK1GQ96NX5 476 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC30A3Q99726 388 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 WWP1Q9H0M0 922 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 TAS2R13Q9NYV9 303 aa29.01■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 NOBOXO60393 691 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 INHBAP08476 426 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SPRP35270 261 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 WASH2PQ6VEQ5 465 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 CD200R1Q8TD46 325 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 APOLD1Q96LR9 279 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 RMDN2Q96LZ7 410 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 GPR22Q99680 433 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 OLFM1Q99784 485 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 OR52A5Q9H2C5 316 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 WASH6PQ9NQA3 447 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 CDYLQ9Y232 598 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 IKBKGQ9Y6K9 419 aa29■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SAT1P21673 171 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 FDXRP22570 491 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SPNS2Q8IVW8 549 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 MREGQ8N565 214 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC37A2Q8TED4 501 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 GLMNQ92990 594 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 VWA7Q9Y334 891 aa28.99■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 CCDC151A5D8V7 595 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 OR52A4PA6NMU1 304 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 GPC4O75487 556 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ITGA2BP08514 1039 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC2A4P14672 509 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 HALP42357 657 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 MAZP56270 477 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 IYDQ6PHW0 289 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 VRK3Q8IV63 474 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM181AQ8N9Y4 354 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 GPR156Q8NFN8 814 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 LATS2Q9NRM7 1088 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 FTSJ1Q9UET6 329 aa28.98■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 ERLIN1O75477 346 aa28.97■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 SHBGP04278 402 aa28.97■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 MYF5P13349 255 aa28.97■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 MSH2P43246 934 aa28.97■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 PGGT1BP53609 377 aa28.97■■■□□ 2.23
LIMCH1-211ENST00000509638 CLCA4Q14CN2 919 aa28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms