RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TMPRSS12Q86WS5 348 aa26.28■■□□□ 1.8
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SH3BP2-212ENST00000508338 PATE1Q8WXA2 126 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM159Q96B96 161 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-212ENST00000508338 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.28■■□□□ 1.8
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLC38A3Q99624 504 aa26.27■■□□□ 1.8
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SH3BP2-212ENST00000508338 CRYL1Q9Y2S2 319 aa26.26■■□□□ 1.79
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SH3BP2-212ENST00000508338 E5RI56 91 aa26.24■■□□□ 1.79
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SH3BP2-212ENST00000508338 PDZD3Q86UT5 571 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 UNC5BQ8IZJ1 945 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 DEPDC7Q96QD5 511 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa26.22■■□□□ 1.79
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