RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SGTAO43765 313 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1I1O60431 355 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CPNE6O95741 557 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRM3P20309 590 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH4A1P30038 563 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CA5AP35218 305 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 RPE65Q16518 533 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 HES3Q5TGS1 186 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SPRED1Q7Z699 444 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PHC3Q8NDX5 983 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 LPGAT1Q92604 370 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP36Q96G28 342 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf66Q96MD2 445 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ZMYND15Q9H091 742 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 WWP1Q9H0M0 922 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RY12Q9H244 342 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFATQ9P243 1243 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MATN2O00339 956 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PPM1DO15297 605 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 S1PR4O95977 384 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS56P0CW18 603 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP5DP30049 168 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 FMO4P31512 558 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PHBP35232 272 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC19A1P41440 591 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC7A5Q01650 507 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MGAT5Q09328 741 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA3AQ14563 771 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP9Q49MG5 647 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MSS51Q4VC12 460 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PERM1Q5SV97 790 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ9Q92806 393 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 TP73O15350 636 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS26AO75436 327 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CBSLP0DN79 551 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MYF5P13349 255 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 BRAFP15056 766 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 AMD1P17707 334 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 STX2P32856 288 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CBSP35520 551 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC1A2P43004 574 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL7P80098 99 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CTBP1Q13363 440 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 SLMAPQ14BN4 828 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CLCA4Q14CN2 919 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP2-208ENST00000504294 PDZD3Q86UT5 571 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms