RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496567.5

C9orf3-222, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, human

TSL 5

Gene C9orf3, Length 1,575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C9orf3-222	ENST00000496567	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	PRR19	A6NJB7	356 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	RASGRF2	O14827	1237 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	PCDHGA12	O60330	932 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	CDH16	O75309	829 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	ANXA6	P08133	673 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TGM1	P22735	817 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	IQCK	Q8N0W5	287 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	MTBP	Q96DY7	904 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	OLFM1	Q99784	485 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		21.34	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	GPC4	O75487	556 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	STMN1	P16949	149 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TAS2R39	P59534	338 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	BMPR2	Q13873	1038 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC25A45	Q8N413	288 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	CD200R1	Q8TD46	325 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	GALP	Q9UBC7	116 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	NFS1	Q9Y697	457 aa		21.33	■■□□□ 1.01
C9orf3-222	ENST00000496567	FRYL	O94915	3013 aa		21.33	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	TPP1	O14773	563 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	YY2	O15391	372 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SNX2	O60749	519 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLCO1A2	P46721	670 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CASP8	Q14790	479 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	GLMN	Q92990	594 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	TLDC2	A0PJX2	215 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	HMX2	A2RU54	273 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SMIM23	A6NLE4	172 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLCO2B1	O94956	709 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ALPPL2	P10696	532 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC2A4	P14672	509 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SERPINB8	P50452	374 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	RAB10	P61026	200 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	DNAJC3	Q13217	504 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC14A1	Q13336	389 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CROCCP2	Q86T23	111 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	PIM3	Q86V86	326 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ZIM3	Q96PE6	472 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC30A3	Q99726	388 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	TBK1	Q9UHD2	729 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	LAMA1	P25391	3075 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CBSL	P0DN79	551 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	F3	P13726	295 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CRABP2	P29373	138 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ATP5D	P30049	168 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	CBS	P35520	551 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	HAL	P42357	657 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	PREP	P48147	710 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	RGS4	P49798	205 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	GBX1	Q14549	363 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		21.31	■■□□□ 1
C9orf3-222	ENST00000496567	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		21.31	■■□□□ 1

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