RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RUBCN	Q92622	972 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		F5H5T6	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		H0Y626	953 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NPC1	O15118	1278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CACNG3	O60359	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TSPAN3	O60637	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TBL1X	O60907	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DAB1	O75553	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KLKB1	P03952	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SP9	P0CG40	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KRT3	P12035	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ITGB6	P18564	788 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SDC4	P31431	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MAN1A1	P33908	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NNMT	P40261	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PBX1	P40424	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	OPRD1	P41143	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEA1	P43355	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GABRB2	P47870	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DGKE	P52429	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FMO1	Q01740	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TCF15	Q12870	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CDH18	Q13634	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	STARD3	Q14849	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCT6B	Q92526	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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