RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493583.5

TFE3-204, Transcript of transcription factor binding to IGHM enhancer 3, human

TSL 2

Gene TFE3, Length 3,279 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFE3-204	ENST00000493583	CCNC	P24863	283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CLCN5	P51795	746 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NUDT6	P53370	316 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FAR2	Q96K12	515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SLC22A2	O15244	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MGEA5	O60502	916 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NDUFS3	O75489	264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CRHR2	Q13324	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	VAT1	Q99536	393 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SARDH	Q9UL12	918 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	LDB2	O43679	373 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SSX4	O60224	188 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SULT1C4	O75897	302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	BMP4	P12644	408 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	S100A1	P23297	94 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	RGR	P47804	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	HSPA7	P48741	367 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	GATM	P50440	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	HK3	P52790	923 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	DAG1	Q14118	895 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	OR1E1	P30953	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	UPK1A	O00322	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	IRAK2	O43187	625 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CHRNA1	P02708	482 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	ALPL	P05186	524 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CTPS1	P17812	591 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FLT3LG	P49771	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583		Q6ZSR9	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	NODAL	Q96S42	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TFE3-204	ENST00000493583		E5RI56	91 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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