RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 VDAC3Q9Y277 283 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PROB1E7EW31 1015 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM70O94826 608 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CAMTA2O94983 1202 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 BMP10O95393 424 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00271P0C7V0 271 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 AMPHP49418 695 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR52I2Q8NH67 350 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMED6Q8WW62 240 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF558Q96NG5 402 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MGME1Q9BQP7 344 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 NEURL2Q9BR09 285 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR52Z1P0C646 297 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T7P0C7T2 308 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MYOD1P15172 320 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MUTP22033 750 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC13P31276 330 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 BMXP51813 675 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CAPZA1P52907 286 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM1Q08AH1 577 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 NFATC4Q14934 902 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 GLRX5Q86SX6 157 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ELP5Q8TE02 316 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SMPDL3BQ92485 455 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SPDL1Q96EA4 605 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SFXN2Q96NB2 322 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPM1 405 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNHIT1O43257 154 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GPR137BO60478 399 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2P2O95744 297 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FAM106CPP0CH98 169 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR1AP12314 374 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 DAOP14920 347 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF23P17027 643 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KRT2P35908 639 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA1BP68363 451 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SCN1BQ07699 218 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 DLG1Q12959 904 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MIB2Q96AX9 1013 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 RHCGQ9UBD6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM178BH3BS89 294 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM77I1YAP6 450 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MEIS2O14770 477 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ASCL1P50553 236 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MLLT10P55197 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2H2Q13888 395 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL26Q53HC5 615 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4DQ92854 862 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 EXT2Q93063 718 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ERO1AQ96HE7 468 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.38□□□□□ -1.23
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