RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 OAS2P29728 719 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 CERS6Q6ZMG9 384 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 ESX1Q8N693 406 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 ULK4Q96C45 1275 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf66Q96MD2 445 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM121Q9BTD3 319 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 IMPACTQ9P2X3 320 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-211ENST00000490677 SLC24A2Q9UI40 661 aa27.15■■□□□ 1.94
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HOXB3-211ENST00000490677 ZFPM2Q8WW38 1151 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXB3-211ENST00000490677 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
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HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0754O94854 1291 aa27.13■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa27.13■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 SFTPCP11686 197 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 POLE2P56282 527 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL35Q6PF15 583 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 CFAP206Q8IYR0 622 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 ACRV1P26436 265 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 OASLQ15646 514 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINA9Q86WD7 417 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 ATG4AQ8WYN0 398 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 DCUN1D1Q96GG9 259 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 PPM1MQ96MI6 270 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 CD180Q99467 661 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A18Q9H1K4 315 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 CROTQ9UKG9 612 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 FER1L5A0AVI2 2057 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 MROH6A6NGR9 719 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 EBLN1P0CF75 366 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 RALBP11234 206 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 POU6F1Q14863 301 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 P3H1Q32P28 736 aa27.1■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 RASGRP3Q8IV61 690 aa27.1■■□□□ 1.93
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HOXB3-211ENST00000490677 NRTNQ99748 197 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 COG4Q9H9E3 785 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 SEC16AO15027 2179 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 SUV39H1O43463 412 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 DLSTP36957 453 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 TUBB3Q13509 450 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 KMT5CQ86Y97 462 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN19Q8N6F1 224 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-211ENST00000490677 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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