RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D4O60343 1298 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNAPINO95295 136 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FABP1P07148 127 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SBK3P0C264 359 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRM3P20309 590 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAP1GAPP47736 663 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSTP61278 116 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLIN5Q00G26 463 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF91Q05481 1191 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTDC1Q4AE62 458 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ODR4Q5SWX8 454 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC23Q5W5X9 447 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ILDR2Q71H61 639 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX20Q7Z614 316 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFX6Q8HWS3 928 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PQLC3Q8N755 202 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENKURQ8TC29 256 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 COQ8BQ96D53 544 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NARFQ9UHQ1 456 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB23Q9ULC3 237 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMX2Q9Y320 296 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PQ09 198 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR27A2RRH5 827 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KPNA7A9QM74 516 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L15C9J2P7 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L11C9JVI0 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L18D6R9N7 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L22D6RA61 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L19D6RCP7 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L20D6RJB6 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP11A1P05108 521 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP3A4P08684 503 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD17B1P14061 328 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZP3P21754 424 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDELR1P24390 212 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLA-DMAP28067 261 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RARRES1P49788 294 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35A2P78381 396 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ROR1Q01973 937 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L24Q0WX57 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKAA1Q13131 559 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFIXQ14938 502 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP6Q16828 381 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR158Q5T848 1215 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNEQ86WN2 208 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMER2Q8N7J2 671 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C19orf60Q96EN9 201 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF145Q96MT1 663 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRMD6Q96NE9 622 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 LDAHQ9H6V9 325 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF121Q9H920 327 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSADQ9Y600 493 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGB4P16144 1822 aa6.8□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2A25A4D2G3 310 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C9JVG2 144 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FXYD1O00168 92 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms