RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	PTH2R	P49190	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TAF6	P49848	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PON2	Q15165	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	E2F5	Q15329	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TOMM20	Q15388	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEC23B	Q15437	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LPAL2	Q16609	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ME3	Q16798	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DMD	P11532	3685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		E9PMD0	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CLIC1	O00299	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC16A4	O15374	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CNTN5	O94779	1100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MT-CO3	P00414	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CYP4B1	P13584	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CHM	P24386	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	IFNAR2	P48551	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	VPS41	P49754	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MYL7	Q01449	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TSPY1	Q01534	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PRKG2	Q13237	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KCNB1	Q14721	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PLK5	Q496M5	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CD101	Q93033	1021 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CD180	Q99467	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	COL4A2	P08572	1712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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