RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SLC4A1	P02730	911 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	HBQ1	P09105	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PIRT	P0C851	137 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	GZMA	P12544	262 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CDH3	P22223	829 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PREP	P48147	710 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	XRCC4	Q13426	336 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	KRT81	Q14533	505 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MLIP	Q5VWP3	458 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	FJX1	Q86VR8	437 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	GDAP1	Q8TB36	358 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	AGAP3	Q96P47	875 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	TRIB3	Q96RU7	358 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	POMT2	Q9UKY4	750 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ZNF711	Q9Y462	761 aa		10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279		E7EQ34	232 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ZNF749	O43361	778 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CD63	P08962	238 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CD48	P09326	243 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	FOLR3	P41439	243 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	UBXN1	Q04323	297 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PRKAA1	Q13131	559 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	NFE2L1	Q14494	772 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	HIF1A	Q16665	826 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	RELT	Q969Z4	430 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	PCM1	Q15154	2024 aa		10.28	□□□□□ -0.76
APTX-222	ENST00000478279	MASP2	O00187	686 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MATN2	O00339	956 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MAP3K7	O43318	606 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CBSL	P0DN79	551 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MYBL1	P10243	752 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ST6GAL1	P15907	406 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HLA-DPA1	P20036	260 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MX2	P20592	715 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CBS	P35520	551 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ARSE	P51690	589 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CTSC	P53634	463 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CDC16	Q13042	620 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CCNY	Q8ND76	341 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PTER	Q96BW5	349 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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