RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	FOXM1	Q08050	763 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SQSTM1	Q13501	440 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PCID2	Q5JVF3	399 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CASC4	Q6P4E1	433 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL35	Q6PF15	583 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	COG1	Q8WTW3	980 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ELMO1	Q92556	727 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF778	Q96MU6	729 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	TAAR9	Q96RI9	348 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	RANBP9	Q96S59	729 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	COG4	Q9H9E3	785 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	UCK1	Q9HA47	277 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	BFAR	Q9NZS9	450 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OGFR	Q9NZT2	677 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL33	A6NCF5	533 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	AGAP14	A8MT82	685 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF185	O15231	689 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SGTA	O43765	313 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OR56A5	P0C7T3	313 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	LIPC	P11150	499 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	FOXN2	P32314	431 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	NSG1	P42857	185 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CAPZB	P47756	277 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ARL4D	P49703	201 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	UCN	P55089	124 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	GNG11	P61952	73 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CLN3	Q13286	438 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	MANEA	Q5SRI9	462 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ANKS6	Q68DC2	871 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	TTC27	Q6P3X3	843 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OR4L1	Q8NH43	312 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PMEPA1	Q969W9	287 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf72	Q96LT7	481 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SYBU	Q9NX95	663 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	USP27X	A6NNY8	438 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880		F8W8V4	182 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	AP3B1	O00203	1094 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OR1I1	O60431	355 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	FTH1	P02794	183 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	NPY2R	P49146	381 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	RAB15	P59190	212 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ITIH4	Q14624	930 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R7	Q15435	360 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CES3	Q6UWW8	571 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	VASH2	Q86V25	355 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OOSP2	Q86WS3	158 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	HGH1	Q9BTY7	390 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	IL22	Q9GZX6	179 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SNX12	Q9UMY4	172 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C74	A6NCV1	312 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	STMND1	H3BQB6	276 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	QSOX1	O00391	747 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	PHF2	O75151	1096 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	AP2A2	O94973	939 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	TPSB2	P20231	275 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS1	P28331	727 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SSR4-208	ENST00000471880	NMBR	P28336	390 aa		14.45	□□□□□ -0.1

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