RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 BMP10O95393 424 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GCNT3O95395 438 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CAVIN2O95810 425 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CD4P01730 458 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SELLP14151 372 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CHRNB4P30926 498 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MLLT10P55197 1068 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK11-1P61568 191 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GNB1P62873 340 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SPOCK1Q08629 439 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 LRMPQ12912 555 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2V1Q13404 147 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PXKQ7Z7A4 578 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP97Q8IW35 865 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HACE1Q8IYU2 909 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM58Q8NG06 486 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 RDM1Q8NG50 284 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PELI2Q9HAT8 420 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC38A7Q9NVC3 462 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PTCH1Q13635 1447 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP1Q9C000 1473 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 LIPT2A6NK58 231 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 B4E171 279 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD66B4E2M5 251 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SCAMP1O15126 338 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB43O43298 467 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GPC4O75487 556 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HIST1H2ABP04908 130 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PRSS56P0CW18 603 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM11P17152 192 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HIST1H2ADP20671 130 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CHMP24386 653 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP2K2P36507 400 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN7P41732 249 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MSH2P43246 934 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MMP15P51511 669 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAMEP78395 509 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MPP1Q00013 466 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.818e-10■■□□□ 12
RABGGTB-206ENST00000467748 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 FCN2Q15485 313 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 BRINP3Q76B58 766 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 UCMAQ8WVF2 138 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 WBP1Q96G27 269 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 AASSQ9UDR5 926 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ACAD8Q9UKU7 415 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 FLT1P17948 1338 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GU03 582 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 OR2M5A3KFT3 312 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HHLA1C9JL84 531 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 OGG1O15527 345 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDH7O60245 1069 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPK4P31152 587 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ARL3P36405 182 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR143P51810 404 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CTSCP53634 463 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R2BQ00005 443 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SARM1Q6SZW1 724 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PACS1Q6VY07 963 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF534Q76KX8 674 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PTOV1Q86YD1 416 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TMTC2Q8N394 836 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SEMA4DQ92854 862 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms