RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA3	P43357	314 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ITGA8	P53708	1063 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GABRE	P78334	506 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SYTL3	Q4VX76	610 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CDC23	Q9UJX2	597 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SATB2	Q9UPW6	733 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ACACA	Q13085	2346 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	APC2	O95996	2303 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FAM187A	A6NFU0	413 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	BANF1	O75531	89 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GSTM1	P09488	218 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ARNT	P27540	789 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PREP	P48147	710 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PDX1	P52945	283 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	EPHA4	P54764	986 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GSTM4	Q03013	218 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GPR18	Q14330	331 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PLCL1	Q15111	1095 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NEPRO	Q6NW34	567 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PDIK1L	Q8N165	341 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GPR150	Q8NGU9	434 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PWWP2A	Q96N64	755 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DPH5	Q9H2P9	285 aa		17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	LILRA5	A6NI73	299 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	IQCF5	A8MTL0	148 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902		A8MU76	341 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SMAP	O00193	183 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RAD51C	O43502	376 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	USP1	O94782	785 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	UBXN7	O94888	489 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PGAM1	P18669	254 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PDHA2	P29803	388 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CSF2RB	P32927	897 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HIF1A	Q16665	826 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	LONRF1	Q17RB8	773 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MSS51	Q4VC12	460 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM135	Q86UB9	458 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	UCK1	Q9HA47	277 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	KLHL3	Q9UH77	587 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		17.35	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	LAMA5	O15230	3695 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NDC80	O14777	642 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	BRINP1	O60477	761 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TUBB4A	P04350	444 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FMO4	P31512	558 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CCKBR	P32239	447 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ARL4C	P56559	192 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CFHR1	Q03591	330 aa		17.34	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37

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