RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 TBR1Q16650 682 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 HM13Q8TCT9 377 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.45■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC35G4P0C7Q5 338 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 PRSS56P0CW18 603 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 NELFEP18615 380 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNG1Q06432 222 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ABHD18Q0P651 414 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SEPT6Q14141 434 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 PLCL1Q15111 1095 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 RPS6KA1Q15418 735 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 UBXN4Q92575 508 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OR6C1Q96RD1 312 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.44■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OR5K3A6NET4 321 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SUN1O94901 812 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 FDFT1P37268 417 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CDH17Q12864 832 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP7Q14244 749 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 GSE1Q14687 1217 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF605Q86T29 641 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC41A2Q96JW4 573 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 HRASLS2Q9NWW9 162 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 IFNB1P01574 187 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 FGF5P12034 268 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 COG4Q9H9E3 785 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ETS1P14921 441 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF28P17035 718 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 NDUFS1P28331 727 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SNX1Q13596 522 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 DBN1Q16643 649 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ESX1Q8N693 406 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CLDN19Q8N6F1 224 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CD180Q99467 661 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K3Q99759 626 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ULBP3Q9BZM4 244 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC78A2IDD5 438 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 B8ZZF3 427 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SPAG6O75602 509 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 AP2A2O94973 939 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CD151P48509 253 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SEMA5AQ13591 1074 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 KRT33BQ14525 404 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC38Q502W7 563 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OOSP2Q86WS3 158 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 KMT5CQ86Y97 462 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 RASGRP3Q8IV61 690 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CB-208ENST00000455580 OR6C74A6NCV1 312 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 TLCD2A6NGC4 264 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 GAS8O95995 478 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 GSTM1P09488 218 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC175P0C221 793 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 FOLR1P15328 257 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 FOXN2P32314 431 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 STAT5AP42229 794 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 GRIA1P42261 906 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 NSG1P42857 185 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 LMAN1P49257 510 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 GSTM4Q03013 218 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CB-208ENST00000455580 RPA4Q13156 261 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms