RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455546.6

GTF3C3-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, human

TSL 4

Gene GTF3C3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	BLACE	A4D250	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	MSTN	O14793	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AURKA	O14965	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	NKX2-8	O15522	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PRODH	O43272	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GRID2	O43424	1007 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	MTX2	O75431	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PROSC	O94903	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SLC4A1	P02730	911 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CD3E	P07766	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	FURIN	P09958	794 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	THRA	P10827	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	LIF	P15018	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZNF30	P17039	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	NFKBIA	P25963	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TEAD1	P28347	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GPR3	P46089	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SPINT3	P49223	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	HHEX	Q03014	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AP1B1	Q10567	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PDK2	Q15119	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	COX14	Q96I36	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CHP1	Q99653	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	CDH19	Q9H159	772 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ATM	Q13315	3056 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	ZW10	O43264	779 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	DUX1	O43812	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	NUAK1	O60285	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	RAD1	O60671	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	PMPCB	O75439	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	TGFB1	P01137	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	KRT7	P08729	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF3C3-208	ENST00000455546	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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