RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEA1Q16626 185 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST3GAL2Q16842 350 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATS1Q496A3 300 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACCSLQ4AC99 568 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINGO4Q6UY18 593 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM131BQ86XD5 332 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK40Q8N2I9 435 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 AADATQ8N5Z0 425 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T3Q8NH03 318 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGSF8Q969P0 613 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCDQ96DY2 449 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOD1Q96IK1 185 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG5Q96R06 1193 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM245Q9H330 911 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPP6Q9NZW5 540 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS28Q9UK41 221 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAP1Q9ULZ2 295 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITPR1Q14643 2758 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHD6Q8TD26 2715 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGALS16A8MUM7 142 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ERQ8 282 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPC1O15118 1278 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BP5O60239 455 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNAP91O60641 907 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRGAP2O75044 1071 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINF2P08697 491 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNSP15586 552 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF18P17022 549 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 GATA3P23771 443 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRM1P23921 792 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 MATKP42679 507 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADPRHP54922 357 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOXL3P58215 753 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECT2LQ008S8 904 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 BNC1Q01954 994 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBXN1Q04323 297 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEUP1Q05D60 604 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENPP2Q13822 863 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST6Q15828 149 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA1AQ53H76 456 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALFQ53S48 1182 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXL22Q6P050 247 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms